从河北跟着军人传来京师的瘟疫也开始大规模传染，京师日死人以数千计，病死的老百姓铺满了街道。
崇祯六年九月初九，李贼大军以十天十夜打通了永定门的地道，随后以三千斤火药爆破墙体，溃散官军涌入城内劫掠。朝廷大惊，秦文君等人入宫，圣人对出奔一事很犹豫，借口要去煤山逛一逛。秦文君怒，与温体仁等大臣用强，将圣人劫出了皇宫。事发仓促，秦文君也顾不得那多了，只带上了圣人的五个子女和周皇后、张太后、田氏、袁氏等妃嫔女御数十，以及英国公张之极、广陵侯田悦等少数勋贵，在五千虎贲军的护送下仓皇出逃。
曹化淳带着二十四局上万宦官宫女以及大量财货禁兵紧随其后。
文武百官不知圣人去向。
次日拂晓，上朝的官员发现皇宫的异常后，随即向北京市民宣布了圣人出逃这一噩耗。得知圣人出逃，国人哭声震天。百官勋贵士绅，或就地躲藏，或便装出逃，总之一片纷乱。
……
“怎么停下来了？”
北京的最新情况已经传到了秦文君手里。
得知圣人出奔，军民震动，建奴随即入城，皇太极下令赈灾，饥饿的北京市民夹道欢呼，京师官员自备辇车香案，迎接皇太极入城。建奴纪律森严，入北京后于市民秋毫无犯，有无赖子偷盗皇宫，在坊间纵火奸淫，皆为建奴逮捕，当众斩首。
就在皇太极入城当日。
洪承畴、傅宗龙、杨文岳集结二十万兵马会讨李贼。先后于九月十一日和九月十三日，于永定门和宣武门击溃李贼断后人马，闯军前营制将军李自成部下谷可成战死。李师道大战洪承畴，重创陕军。傅宗龙发血书讨李贼，左良玉诸帅不敢出。
九月十五，李贼大举撤离京师，退保天津卫观察局势。
与此同时，在皇太极入城之后，建奴分三路同时出击，西路由满洲一等总兵官扬古利率领，以三万铁骑，经张家口直扑大同，一路追杀朱由检，张家口守备唐汶杀死监军降于扬古利。
中路由阿巴泰、岳托、鳌拜、杜度、尚可喜、耿仲明等人率领，紧盯李师道主力死追，意图将李贼歼灭于黄河以北。今天是九月十六，料想建奴已过真定府，最迟将在三天后决战李贼！
东路豪格经河间府直取济南，山东巡抚朱大典率五万大军结阵迎战，为豪格七千甲兵击溃。
混战，大乱斗。
皇太极、李师道、洪承畴、傅宗龙、杨文岳、左良玉、李自成、黄得功、吴三桂、周遇吉、刘泽清……都是狠货，斗吧斗吧，看谁能笑到最后。
“太子走不动了。”来人禀道。
秦文君闻言大怒，直接跳下马车，走到累得气喘吁吁的朱慈烺跟前，看着这个圣人的嫡长子，他的学生，黑着脸问道：“太子还跟得上么？扬古利旦夕而至，不怕他把你掳去？”
“若有马，还能走。”看见秦文君过来，太子下意识有些害怕。
“此深山，焉得马！”
“寡人气虚体弱，实在走不动了。”
秦文君抿着嘴不说话，正待给太子上一堂散打课，周皇后突然从后面追了上来，泪流满面，哽咽道：“学士勿伤我儿！”
随即几个大步冲上来把太子抱在怀里，坤仪公主和朱慈炯几个小家伙早已哭成了泪人。秦文君烦躁不已，让妻子鹿氏去把四岁的朱微敏抱过来照顾，给皇后帮帮忙。正待再说些什么，远处响起了密集的马蹄声，一队虎贲军斥候冲了回来，个个神色惊恐，屁股上都扎满了羽箭。
秦文君脸色骤变。
“大事不好，多半是扬古利的骑卒追来了，咱们这里只有万把军士，先护着圣人走脱。”温体仁匆匆走了过来，急道。
“首辅所言甚是。”秦文君现在也有些慌了。
扬古利来得太快了，手下骑卒又多，而他们收拾东西出宫门花了不少时间，连车马都没找到多少。这才跑出北京多久，就被建奴追上了。
早上跑路惹的祸，被太多人看见了，该晚上悄悄出门的！
温、秦、周、钱四人计议已定，匆匆赶到圣人车驾，禀明情况，没想到圣人倒不是很慌，从容道：“大同朕看是去不得了，现在又往哪里跑？”
“改道去太原！”周延儒脱口而出。
“哎，不若赦免李师道，让他戴罪立功吧。”想到顺天府的乱局，圣人一阵伤心。
“圣君此何意？”
周延儒的脸一下子阴了下来，道：“李师道，叛臣也，若为其所擒，圣君焉能活命？！”
“呵……”
圣人笑了一声，懒得多说。
秦文君急得跺了跺脚，正待示意温体仁用强，却听北面也响起了马蹄声，又一队侦骑仓皇逃了回来。
“扬古利已至四十里外，如何应对请各位长官示下！”
温体仁闻言一呆，身躯不自觉地有些颤抖。
“首辅不要慌，先跑吧！”
秦文君也顾不得其他事情了，匆匆招呼宦官继续赶车。他自己则麻利的脱下官服，换了一身不起眼的灰衣，然后骑上一匹快骡，连甩三鞭，一骑当先冲到了队伍最前面，又找到鹿氏，让妻子带着亲戚孩儿们换衣裳，赶紧离开大队逃命，到太原汇合。
背上背着三岁女儿怀里抱着刚满月的小儿子的鹿氏吓得哭泣了起来。
“哭哭哭，哭甚么！”
秦文君把妻子拉到官道边上，望着怀里抱儿子背上背女儿的鹿氏，却也是泪如雨下，拉着鹿氏的手久久说不出话。
“走、走……”
秦文君以袖掩面，将泪水擦拭掉，重新黑着脸道：“走，现在就给我走！！”
“那你呢？”
“贤夫人不要担心为夫，任他扬古利撒豆成兵，还能捉住为夫不成？”秦文君强颜欢笑，哄了哄妻子。
“秦大夫，建奴侦骑已至十里外，后面至少还有三千骑卒！”
这下不止是秦文君了，圣人也淡定不住了，一遍又一遍催促驾车的王承恩搞快些，周皇后、田氏、袁氏、裴氏、赵氏等妃嫔女御相对哭泣，张太后不悲不喜，似乎看破了生死。
……
崇祯六年九月二十，阿巴泰、豪格、岳托、杜度、尚可喜、鳌拜、耿仲明等人统满、汉、蒙、朝七万大军进薄天津卫，邀击李师道。
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